先秦：《神农本草经》神农氏   《皇帝内经》

汉代：马王堆汉墓医书    《黄帝内经素问》 、张仲景《伤寒杂病论》、张仲景《金匮要略》

唐代：孙思邈，《千金方》，明代：王叔和的《脉经》、皇甫谧《针灸甲乙经》、陶弘景《本草经集注》、葛洪《肘后备急方》、巢元方《诸病源候论》、苏敬《新修本草》 、王焘《外台秘要》、元丹贡布《四部医典》、《太平圣惠方》、王惟一《铜人腧穴针灸图经》 北宋：宋慈《洗冤集录》

回回药方    忽思慧《饮膳正要》、许国祯《御药院方》 、刘完素《素问玄机原病式》、张子和《儒门事亲》、朱丹溪《格致余论》、李东垣《脾胃论》、李时珍与《本草纲目》、刘文泰《本草品汇精要》、吴又可《温疫论》、徐春甫《古今医统大全》、叶天士《临证指南医案》、吴鞠通《温病条辨》、王孟英《温热经纬》、薛生白《湿热条辨》、王清任《医林改错》、《古今图书集成医部全录》、《圣济总录》  

中医古籍还是非常多的，不过很多中医古籍都在国外馆中，比如日本的早稻田图书馆馆藏了很多中医古籍，很多珍稀罕见的中医古籍 也都在里面

另外曾经在 医书网 下载到一些的中医古籍类书籍资料，也都是整理国外一些馆藏的中医古籍资料，都是纯古籍扫描版的中医书籍，非常罕见的，你可以看

内景备览（上下卷）

内科秘录（9卷）

内经知要（上下卷）

切要方义（1-5卷）

千金方药注（1-4卷）

千金方衍义（1-36卷）

千金方（1-32卷）

景岳全书（40卷）

本草经百种录（上中下卷）

歌伤寒杂病论俗辨（上中下卷）

经穴汇解（1-8卷）

经穴纂要（1-5卷）

经络歌括（2卷）

经络腧x学 68讲

经验丹方（四卷）

蔓难录（1-5卷）

蕉窗方意解（一二卷）

蕉窗杂话（2卷）

补正辑光伤寒论（上下卷）

金匮二刘合注（上下卷）

金匮玉函经（1-20卷）

金匮玉函要略论注（6卷）

金匮要略 54讲

金匮要略国字解（1-6卷）

金匮要略心典（3卷）

金匮要略述义（1-4卷）

金匮论注（1-8卷）

金镜内台方义（3卷）

难经小解（1-6卷）

难经抄（一二三卷）

难经本义抄（1-6卷）

难经本义（上下卷）

难经疏证（上下卷）

难经经释（一二卷）

难经铁鉴（5卷）

雷公炮制（1-8卷）

风寒热病方纬篇（1-7卷）

麻疹三书（一二卷）

黄帝内经相关书籍整理（124册）

黄帝内经素问（1-9卷）

中西汇参铜人图说

伤寒蕴要二卷明彭用光著明嘉靖四十年江西官刊本黑白版

元版子部伤寒论注解存7卷（卷1-3缺）汉张机撰金成无己注解元刊1册

元版子部张仲景注解伤寒百证歌新编张仲景注解发微论张仲景注解伤寒百证歌5卷新编张仲景注解发微论2卷宋许叔微述元刊4册

元版子部新刊图解素问要旨论8卷金刘守真撰马宗素重编元刊8册

元版子部新刊惠民御药院方20卷元御药院编元刊10册

元版子部新编南北经验医方大成10卷首目1卷元孙允贤编元刊11册

宋版史部图经严州重修图经存3卷卷1-3宋董弅撰陈公亮刘文富校宋刊明修4册

宋版史部新雕名公纪述老苏先生事实1卷撰者未详南宋刊1册

宋版子部伤寒总病论6卷附音训1卷修治药法1卷宋庞安时撰南宋刊抄补4册

宋版子部史载之方2卷宋史堪撰南宋刊2册

宋版子部外台秘要方40卷首目1卷唐王焘撰南宋刊42册

宋版子部太医张子和先生儒门事亲12卷金张从正撰金刊9帖

宋版子部太医张子和先生儒门事亲零本金张从正撰南宋刊1帖

宋版子部新雕孙真人千金方30卷唐孙思邈撰南宋刊配元明刊本24册

宋版子部普济本事方存6卷（卷1-6）宋许叔微撰南宋刊6册

宋版子部重校证活人书18卷宋朱肱撰南宋刊带图本10册

宋版子部鸡峰普济方存25卷首目1卷宋孙兆撰贾兼重校南宋刊24册

宋版集部新刊校定集注杜诗存6卷唐杜甫撰宋郭知达编宋宝庆元年广东漕司刊3册

类证普济本事方十卷宋许叔微撰清钱氏萃古斋抄本

东汉张仲景著述的《金匮要略》是古代汉医经典著作之一，中国现存最早的一部诊治杂病的中医专著。本书撰于3世纪初，作者原撰《伤寒杂病论》十六卷中的另一部分。经晋王叔和整理后，其古传本之一名《金匮玉函要略方》，共3卷。上卷为辨伤寒，中卷则论杂病，下卷记载药方。后北宋校正医书局林亿等人根据当时所存的蠹简文字重予编校，取其中以杂病为主的内容，仍厘订为3卷，改名《金匮要略方论》。《金匮要略》1是中医经典古籍之一，东汉张仲景撰于3世纪初，属原撰《伤寒杂病论》十六卷中的“杂病”部分。《伤寒杂病论》历经传抄失真失散，伤寒部分经晋太医令王叔和收集、整理、编次，形成《伤寒论》一书，当时杂病部分失传。《伤寒杂病论》古传本之一名《金匮玉函要略方》，被北宋翰林学士王洙发现于翰林院书库，书简共3卷，上卷为辨伤寒，中卷则论杂病，下卷记载药方。后北宋校正医书局林艺等人根据当时所存的蠹简文字重予编校，取其中以杂病为主的内容，仍厘订为3卷，改名《金匮要略方论》。全书共25篇，方剂262首，列举病症六十余种。全书共25篇，方剂262首，列举病症六十余种。所述病证以内科杂病为主，兼有部分外科妇产科等病证。