西藏藏医学院创建于1989年，是西藏三大高校之一，属国家二类学院。学院现有教职员工145人，其中教授2人，副教授9人，是国家财政全额拨款事业单位。学院主要由院党委和院委统一领导，下设藏医药系、科技研究所、教务处、教学药厂等七个县级单位，机构设置齐全、人员精干，是目前国内外最具办学实力的藏医药高等学府。自创建以来，先后为西藏、青海、甘肃、四川、云南等省培养和输送了1000多名藏医药骨干人才，并正在培养藏医药博士和硕士生，为继承和振兴传统藏医药事业发挥了不可替代的作用。
藏医药是中华医药学宝库和藏族文化的重要组成部分，迄今已有3800多年的发展历史，是藏民族智慧的结晶，其历史悠久、内容丰富、影响广泛、典籍浩瀚，是中国第二民族医药学，亦是西藏发展特色经济和支柱产业的一大优势。西藏是藏医药的发祥地，在藏医药3800多年的历史长河里，历代藏医学家为后人留下了许多珍贵的文献典籍，这些即是我国宝贵的文化财富，又是丰富和促进人类文化多元性的主要原素。但随着藏医药事业的蓬勃发展，在藏医药领域也出现了一些新的问题，如很多藏医药名老专家、学者相继谢世，藏医药高层次人才出现断层；许多珍贵的藏医药文物、资料散落在民间和相关单位，没有得到应有保护和管理，藏医药文物、资料毁坏丢失现象严重，再加由于历史年代跨度长，许多流散在民间的重要文献典籍和医疗器械很难进行准确定性和科学鉴别，这对藏医药及天文星算文物的发掘收集和整理工作提出了严峻挑战，并对藏医药文化的继承构成了严重威胁。
西藏藏医学院作为第一所、也是迄今为止唯一一所国家独立设置的最具办学实力的藏医药高等学府，既是培养藏医药高级专业技术人才的摇篮，又是藏医药学术研究、科技开发与应用的基地，也是向世人宣传和展示藏民族优秀文化的窗口。为了体现西藏藏医学院办学特色，充分发挥西藏藏医学院在挖掘、抢救、继承、发展传统藏医药和天文星算方面的特殊作用，结合目前藏医药事业面临的问题和发展现状，学院于2003年开始了筹建“西藏藏医学院藏医药天文星算博物馆”工作。
经过三年多的努力工作，西藏藏医学院博物馆已初具规模,现已制作完成了藏医始祖宇拓•宁玛云丹贡布等九尊大型镏金铜制藏医历史人物塑像和现代著名藏医药学家措如•才朗等七尊小型人物塑像；完成了藏医经典著作《四部医典》、天文星算学巨著《时轮本注》等十几部古籍的金汁刻写工作；策划和完成了藏医史和天文星算史各100多幅唐卡的近一半的绘制工作；搜集和整理了《四部医典》的各类版本和《蓝琉璃》等十几部藏医古籍文献资料；完成了50多种藏医外科器械和80副藏医彩色系列挂图的复制等前期的文物收集、订制工作，并从社会各界先后募集到700多万元资金，做了大量具有前瞻性和创新性的工作，为西藏藏医学院博物馆的顺利建成创造了条件。
总之，西藏藏医学院藏医药天文星算博物馆在自治区党委、政府的亲切关怀和大力支持下，在社会各界的倾心相助和西藏藏医学院全体员工的团结努力下，目前已完成了大部分文物的收集、整理和订制等前期工作，基本形成了“特色明显、文物齐全、管理科学”的专业博物馆，这对进一步加强藏医药文化的保护宣传力度和提高藏医药高等教育办学水平将产生积极作用，并对反驳西方-势力鼓吹“西藏文化毁灭论”提供了一个有力武器。