古籍研究所好。

1、专业：吉林大学古籍研究所更专业专供古籍，吉林大学文学院专业多，不如古籍研究所研究的更透彻、深刻。

2、考学：吉林大学古籍研究所的考研、博士点更多，文学院考研、考博点少，古籍研究所考学更有优势。

最好的自然是古委会直接联系的22家，但有的学校不在所里招生。

北京大学中国古文献研究中心

　　复旦大学古籍整理研究所

　　北京师范大学古籍整理研究所

　　南京大学古典文献研究所

　　吉林大学古籍研究所

　　山东大学古典文献研究所

　　四川大学古籍整理研究所

　　武汉大学古籍整理研究所

　　中山大学中国古文献研究所

　　东北师范大学古籍整理研究所

　　陕西师范大学古籍整理研究所

　　华中师范大学历史文献研究所

　　上海师范大学古籍整理研究所

　　暨南大学中国文化史籍研究所

　　浙江大学古籍整理研究所

　　北京大学中国古代史研究中心

　　南开大学地方文献研究室

　　西北师范大学古籍整理研究所

　　兰州大学古籍整理研究所

　　西南师范大学汉语言文献研究所

　　南开大学古籍与文化研究所

　　华东师范大学古籍整理研究所