大量综合性汇编丛书仍在近代古籍丛书中占显要地位，著名的有：刘承干的《嘉业堂丛书》、张钧衡的《适园丛书》、董康的《诵芬室丛刊》、陶湘的《托跋廛丛刻》、缪荃孙的《云自在龛丛书》、邓实的《古学汇刊》、《风雨楼丛书》、郑振铎的《玄览堂丛书》、赵诒琛的《峭帆楼丛书》、《又满楼丛书》、郑国勋的《龙溪精舍丛书》及罗振玉在宣统至民国间为保存敦煌文献所刊刻的《敦煌石室遗书》、《鸣沙石室佚书》等。影响最为深远、至今仍为学术界普遍重视的，应届《四部丛刊》、《四部备要》、《丛书集成初编》三大古籍丛书。

1 仙传外科集验方、秘传外科方 2 难经校注 3 难经语译 4 难经本义 5 外科精义 6 温疫论 7 血证论 8 研经言 9 良方集腋 10 赤水玄珠全集 11 黄帝内经灵枢注证发微 12 伤寒论校注 13 伤寒六书 14 金匮要略论注 15 厘正按摩要术 16 本草蒙筌 17 新编西方子明堂灸经 18 明医杂著 19 本草从新 20 圣济经 21 子和医集 22 辨证录 23 杨氏家藏方 24 活人书 25 简明医彀 26 黄元御医书十一种 27 针灸大全 28 伤寒论语译 29 病机汇论 30 本草崇原集说 31 经穴解 32 本草衍义 33 幼幼集成 34 诸病源侯论校注 35 针灸易学 36 疡医大全、 37 徐大椿医书全集 38 痘疹辨证 39 疯门全书 40 金匮玉函经二注 41 王旭高临证医案 42 读素问钞 43 妇人大全良方 44 广瘟疫论 45 海药本草 46 喉科指掌 点校本 47 问斋医案（无封面） 48 刘涓子鬼遗方 49 学古诊则 50 人身通考 51 黄帝内经素问校注 52 黄帝内经素问语译 53 伤寒瘟疫条辩 54 世医得效方 55 类证治裁 56 黄帝内经素问注证发微 57 金匮要略校注 58 御药院方 59 太平惠民和剂局方 60 金镜内台方议 61 千金宝要 孙真人海上方 62 伤寒总病论 63 吴鞠通医案 64 形色外诊简摩 65 种福堂公选良方 66 疡科会粹 67 名医别录 68 幼幼新书 69 外科证治全生 70 理虚元鉴·虚损启微 71 吴普本草 72 食物本草 73 中藏经语译 74 中藏经校注 75 脉经语译 76 针灸甲乙经校注（上下册） 77 本草易读 78 医学指归 79 胎产心法 女科辑要 80 外科证治全书 81 松峰说疫 82 医方考(附《脉语》)（校点本） 83 仁术便览 84 医灯续焰 85 医方考（附《脉语） 86 验方新编 上 87 验方新编 下 88 黄帝内经太素语译 89 随息居饮食谱 90 医经溯洄集 91 黄帝内经太素校注（上下） 92 祖剂 93 易简方 94 医林改错 95 冯氏锦囊秘录 96 饮膳正要 97 不居集 98 寿世保元 99 古今医统大全（上下） 100 脉经校注 101 古今图书集成医部全录（点校本）第01册-医经注释（上册）(卷1—卷46) 102 古今图书集成医部全录（点校本）第02册-医经注释（下册）(卷47—卷70) 103 古今图书集成医部全录（点校本） 第三册 诊断（卷71—卷92 ） 104 明目至宝 105 秘传眼科龙木论校注 106 蠢子医 107 刘纯医学全书 108 千金翼方校释 109 遵生八笺校注 110 难经正义 111 痰火点雪 112 续名医类案 113 许叔微伤寒论著三种 114 医碥 115 本草经集注 辑校本 116 勉学堂针灸集成（PDF） 117 汤液本草 118 养生月览 119 饮食须知 120 秘传证治要诀及类方 121 小儿推拿广意 122 全生指迷方 洪氏集验方 123 孙真人千金方 附真本千金方 124 景岳全书 125 四明心法 四明医案 126 金匮要略方论本义 127 调燮类编 128 本草求真 129 河间医集 130 小儿药证直诀 131 小儿卫生总微论方 132 神农本草经辑注 133 痧胀玉衡 134 韩氏医通 135 卫济宝书、集验背疽方 136 温疫论补注 137 医门补要 138 医学读书记 139 医学纲目 140 证治准绳 141 古今图书集成医部全录（第4-12册）

国学迷汉上易传十一卷周易卦图三卷周易丛说一卷京氏易八卷南轩易说五卷杨氏易传二十卷易小传六卷系辞补注一卷周易玩辞十六卷周易总义二十卷附考证一卷读易绪言一卷读易一钞易余四卷淮海易谈四卷象数论六卷像象管见四卷序测一卷例略一卷题辞一卷易传五卷易大象说一卷易笺八卷首一卷易说一卷易象汇解二卷易学辨惑一卷逸亭易论一卷周易稗疏一卷周易述义五卷周易通略一卷附校勘记一卷周易寻门余论一卷读易汉学私记一卷卦气解一卷九家易象辨证一卷身易一卷易经象类一卷易释四卷易原十六卷虞氏易象考正一续纂一卷虞氏易义补注一附录一卷重订周易二闾记三卷重订周易小义二卷周易本义辨证补订四卷周易标义三卷周易大衍辨一卷周易古义一卷周易互体卦变考一卷周易解故一卷周易史证四卷附易传偶解一卷周易通论月令二卷周易通用解三卷释义一卷周易消息十四卷周易诸卦合象考一卷卦极图说一卷观象反求录一卷汉儒传易源流一卷劵易苞十二卷附校堪记一卷校堪续记一卷尚书稗疏一卷尚书古义一卷尚书记七卷校逸二卷尚书讲义二十卷尚书考辨四卷尚书注疏二十卷附校勘记一卷书蔡传附释一卷絜斋家塾书钞十二卷附录一卷易例辑略一卷郑易马氏学一卷周易倚数录二卷附图一卷周易虞氏略例一卷汲古阁景宋钞南宋群贤六十家小集57_剪绡集。

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