明确一个问题，《四库全书》并不是纯史书类的书籍，是类似大百科全书类文集。分为经、史、子、集四部，历史属于史部。

史部包括正史类、编年类、纪事本末类、杂史类、别史类、诏令奏议类、传记类、史钞类、载记类、时令类、地理类、职官类、政书类、目录类、史评类等15个大类

基本上来说，《四库全书》篡改部分比较多的在用词上，比如反映民族矛盾、民族压迫和民族战斗精神的作品一般都进行了修改，这对历史并没有多大的影响力。

《四库全书》还有一点就是对一些重大的历史时间不予收录，像扬州十日，嘉定三屠之类的，都不在收录范围内，这对历史是有一定影响的，但不能算为篡改吧？

对历史篡改最严重的在于，《四库全书》把清朝之前的社会描绘得比较黑暗，而把清朝皇帝都描绘成尧舜禹一样的贤人，这是历史的不符合。

总体来说，帝王编的书肯定是服务与帝王的。

按照乾隆“寓禁于征”的指示，当时很多征集到四库馆的语涉禁忌或者不符合儒家正统观念的书籍均遭到禁毁，根本不会收入《四库全书》。已收入的，凡是带有夷、狄、蛮等字眼的大都被改窜，不仅是晚明时期对后金和满清出言不逊的著作，也包括了许多宋朝人对辽金元语带侮贬的著作。经部和子部，被改的可能性确实小一些。其实想读些国学经典，《四库全书》并不算是个好的选择。因为它本身是个政府工程、面子工程，全部是抄本，不是印刷的刻本，几千个抄手难免有粗心的、不认真的，加上乾隆对进度又催得很紧，所以即便不考虑篡改的问题，其中的文字讹误也多得惊人。在版本学界，尽量不优先使用《四库全书》本是公论，除非没有其他现存的版本或者它所依据的底本很好且已不存。当然，如果你立志要研究《四库全书》，那是要精读的，不过也要和其他版本相对照。

主要是战乱和人为的销毁。战乱容易理解，关于人为的销毁：

比如秦始皇统一中国后，颁布《焚书令》，禁止民间收藏图书，凡是民间收藏的《诗》、《书》及诸子百家的著作，全都要送交官府，集中烧毁。

再比如清代编纂《四库全书》，实际上目的是将古代的文籍篡改以删去不利之处保留对其有利的部分。所以这并不是什么文化整理，而是粉饰的焚书坑儒，而且较之有过之而无不及，其中大量珍贵的史料遭到篡改或销毁。

《四库全书》是在乾隆皇帝的主持下，由纪昀等360多位高官、学者编撰，3800多人抄写，耗时十三年编成。丛书分经、史、子、集四部，故名四库。共有3500多种书，79万卷，36万册，约8亿字，基本上囊括了中国古代所有图书，故称“全书”。当年，乾隆皇帝命人手抄了7部《四库全书》，下令分别藏于全国各地。先抄好的四部分贮于紫禁城文渊阁、辽宁沈阳文溯阁、圆明园文源阁、河北承德文津阁珍藏，这就是所谓的“北四阁”。后抄好的三部分贮扬州文汇阁、镇江文宗阁和杭州文澜阁珍藏，这就是所谓的“南三阁”。

《四库全书》完成至今的两百年间，饱经沧桑，多份抄本在战火中被毁。其中文源阁本在1860年英法联军攻占北京，火烧圆明园时被焚毁，文宗、文汇阁本在太平天国运动期间被毁；杭州文澜阁藏书楼1861年在太平军第二次攻占杭州时倒塌，所藏《四库全书》散落民间，后由藏书家丁氏兄弟收拾、整理、补抄，才抢救回原书的四分之一。文澜阁本在民国时期又有二次补抄。1914年在杭州图书馆第一任馆长钱恂的支持下，由徐锡麟二弟徐仲荪及其学生堵福诜自费补抄，历时7年，史称“乙卯补抄”。1923年，时任浙江教育厅长的张宗祥得知徐仲荪、堵福诜的义举后，十分感动，但他知道“修补”量相当浩大，单靠几个人很难完成，必须由政府牵头。在他的重视下，补抄人员增加到百余人，费用全部由浙江籍人募集，徐仲荪任总校，堵福冼任监理，历时两年，史称“癸亥补抄”。解放初，由于徐仲荪和堵福洗修补《四库全书》有功，他们俩的画像曾被悬挂在杭州文澜阁，以志纪念。2008年后《四库全书》大部分内容已经恢复。如今《四库全书》只存3套半，其中文渊阁本原藏北京故宫，后经上海、南京转运至台湾，现藏台北故宫博物院（也是保存较为完好的一部）。文溯阁本1922年险些被卖给日本人，现藏甘肃省图书馆。文津阁本于1950年由中国政府下令调拨到中国国家图书馆，这是唯一一套原架原函原书保存的版本。而文澜阁本则藏于浙江省图书馆。

1966年10月，当时正处于中苏关系紧张时，为保护《四库全书》安全，林彪下令将文溯阁《四库全书》秘密从沈阳运至兰州，藏於戈壁沙漠中。辽宁有关人士要求归还，以书阁合璧。甘肃方面也修建藏书楼，加强保护。文溯阁《四库全书》其最终归属仍处争议中

个人认为都是正确原因，如果非要选一个不那么严重的，感觉是是国运不济

战争一定会造成毁坏，被毁灭的东西太多，典籍更是无法避免损毁。

官府垄断，由于官吏不作为，或是统治者要求，甚至可能造成官方的毁书。

水火等灾祸就更是了，古代书的数量少，又不能像现在一样大量印刷复制，很容易一件孤本一把火就没了。

只有国运不济……比方说南陈、南唐这些国家，不行了，亡国了，但典籍还会被下个国家继承。但我觉得也很容易造成损坏，只是不一定有那么直接。